文献速递第期新型冠状病毒感染的

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大家好，今天翻译和分享的文章这两天在朋友圈争论很大的新英格兰医学杂志在年1月29日在线发表的文章，我仔细阅读和翻译了原文，尤其是图1，其实是可以看到在整个疫情过程中卫健委和疾控中心做的大量认真细致的工作。请各位咸丰帝（闲疯的）不要被某些捕风捉影的谣言所迷惑。

新型冠状病毒感染的肺炎在中国武汉的早期传播动力学QunLi,M.Med.,XuhuaGuan,Ph.D.,PengWu,Ph.D.,XiaoyeWang,M.P.H.,LeiZhou,M.Med.,YeqingTong,Ph.D.,RuiqiRen,M.Med.,KathyS.M.Leung,Ph.D.,EricH.Y.Lau,Ph.D.,JessicaY.Wong,Ph.D.,XuesenXing,Ph.D.,NijuanXiang,M.Med.,YangWu,M.Sc.,ChaoLi,M.P.H.,QiChen,M.Sc.,DanLi,M.P.H.,TianLiu,B.Med.,JingZhao,M.Sc.,ManLi,M.Sc.,WenxiaoTu,M.Med.,ChudingChen,M.Sc.,LianmeiJin,M.Med.,RuiYang,M.Med.,QiWang,M.P.H.,SuhuaZhou,M.Med.,RuiWang,M.D.,HuiLiu,M.Med.,YingboLuo,M.Sc.,YuanLiu,M.Med.,GeShao,B.Med.,HuanLi,M.P.H.,ZhongfaTao,M.P.H.,YangYang,M.Med.,ZhiqiangDeng,M.Med.,BoxiLiu,M.P.H.,ZhitaoMa,M.Med.,YanpingZhang,M.Med.,GuoqingShi,M.P.H.,TommyT.Y.Lam,Ph.D.,JosephT.K.Wu,Ph.D.,GeorgeF.Gao,D.Phil.,BenjaminJ.Cowling,Ph.D.,BoYang,M.Sc.,GabrielM.Leung,M.D.,andZijianFeng,M.Med.摘要背景新型冠状病毒（-nCoV）感染的肺炎（NCIP）最初病例于年12月和年1月在中国湖北省武汉市发生。我们分析了武汉市前例确诊病例的数据，以确定NCIP的流行病学特征。方法我们收集了截至年1月22日已报告的实验室确诊NCIP病例的人口统计学特征，接触史和疾病时间表的信息。我们描述了病例的特征并估算了主要的流行病学时延分布。在指数增长的早期，我们估计了疫情的倍增时间和基本再生数。结果在前名确诊NCIP的患者中，中位年龄为59岁，男性为56％。到年1月1日之前发病的大多数病例（55％）与华南海产品批发市场接触有关，而随后的病例为8.6％。平均潜伏期为5.2天（95％置信区间[CI]为4.1-7.0天），分布的第95个百分位数为12.5天。在早期阶段，该流行病每7.4天增加一倍。平均连续间隔为7.5天（95％CI，5.3-19天），基本再生数估计为2.2（95％CI，1.4-3.9）。结论根据这些信息，有证据表明自年12月中旬以来在亲密接触者之间已经发生了人与人之间的传播。如果其他地方也出现类似的情况，则需要作出相当大的努力减少传播，以控制疫情。应在高危人群中采取预防或减少传播的措施。（由中国科学技术部等资助）实验室检测-nCoV实验室测试分析是基于先前的WHO建议。从患者身上获取上、下呼吸道标本。提取RNA并使用-nCoV特异的引物和探针通过实时RT-PCR进行检测。检测在湖北省疾控中心的生物安全2级设施中进行，然后在中国疾控中心的国家病毒性疾病控制研究所进行复核。如果通过特异性实时RT-PCR检测到两个靶标（开放阅读框1a或1b，冠状病毒核衣壳蛋白）呈阳性，则该病例被认为是实验室确诊。将小于37的循环阈值（Ct值）定义为阳性，将大于等于40的Ct值定义为阴性。Ct值为37-40的为中等负载，需要通过重新测试进行确认。如果重复的Ct值小于40，并且观察到明显的峰，或者如果重复的Ct值小于37，则重新检测为阳性。通过以下三种方法之一从患者的支气管肺泡灌洗液样本中鉴定出基因组：Sanger测序，Illumina测序或纳米孔测序。在中国疾病预防控制中心增强的3级生物安全实验室设施中，将呼吸道标本接种到细胞中进行病毒分离。结果：流行病的发生跟随病例呈指数增长，最近几天的下降很可能是由于对最近发作的疑似病例的不确定性以及鉴定和报告的延迟，而不是发病率的真正拐点（图.1）。具体而言，曲线的后半部分并不表示事件案例数量的减少，而是由于截止日期之前确诊病例的时间延迟。考虑到随着时间的推移，检测试剂盒的获得性和使用量会增加，因此在解释1月份病例的增长速度时应格外小心。最早的病例中大多数包括华南海鲜批发市场的暴露报告，但从12月下旬开始，非关联病例的数量呈指数增长。图1.中国武汉首批确诊的例新型冠状病毒（-nCoV）感染肺炎（NCIP）病例的疾病发生图1月8日之后的发病率下降可能是由于诊断和实验室确认的延迟。中国CDC：中国疾病预防控制中心，NHC：中华人民共和国国家卫生健康委员会，PCR：聚合酶链反应，WHC：武汉卫健委，WHO：世界卫生组织患者的中位年龄为59岁（范围为15-89岁），在名患者中，有名（56％）是男性。十五岁以下的儿童中没有发病病例。我们研究了三个时期的病例特征：第一个时期是1月1日（华南海鲜批发市场关闭之日）之前发病的患者。第二阶段是发病时间为1月1日至1月11日的患者，这是向武汉提供RT-PCR试剂的日期。第三阶段是那些在1月12日或之后发病的人（表1）。发病较早的患者年龄稍大一些，男性较多，而且更有可能报告有华南海鲜批发市场。在这三个时期中，医护人员中的病例比例逐渐增加（表1）。我们调查了10例确诊病例的暴露数据，估计平均潜伏期为5.2天（95％置信区间[CI]为4.1-7.0天）；分布的第95个百分位是12.5天（95％CI，9.2-18）（图2A）。我们获得了5个病例组的信息，如图3所示。根据这些病例中6对病例的发病日期，我们估计发病间隔分布的平均值（±SD）为7.5±3.4天（95％CI，5.3-19）（图2B）。在截至年1月4日的流行曲线中，流行增长率为每天0.10（95％CI，0.-0.16），而倍增时间为7.4天（95％CI，4.2-14）。使用上面的序列间隔分布，我们估计R0为2.2（95％CI，1.4-3.9）。图2.关键的事件发生时间分布。估计的潜伏期分布（即从感染到发病的时间）显示在A中。估计的发病时间间隔分布（即在传播链中连续病例的发病时间间隔）显示在B中。估计的从发病到第一次就诊的时间分布在C中。D组显示了入院后的疾病发作。在1月1日之前发病的45名患者从发病到首次就诊的持续时间估计平均为5.8天（95％CI，4.3-7.5），与1月1日到1月11日之间的名发病的患者相似，平均为4.6天（95％CI，4.1-5.1）（图2C）。在1月1日之前发病的44例患者中，从发病到入院的平均持续时间估计为12.5天（95％CI，10.3-14.8），比1月1日至11日之间的例发病的平均时间更长（平均9.1天；95％CI为8.6-9.7）（图2D）。我们没有针对1月12日或之后发病的患者绘制这些分布图，因为尚未发现那些近期发病且病程较长的患者。总之，我们发现在此阶段，武汉市大约每7.4天NCIP病例的数量就增加一倍。自12月中旬以来，人与人之间就已经发生传播，并在随后的一个月内逐渐传播开来。紧迫的下一步措施包括确定最有效的控制措施，以减少社区中的传播。随着对流行病学特征和疫情动态的更多了解，工作病例定义可能需要进一步完善。应当继续监测病例的特征，以发现流行病学的任何变化，例如，年龄较小的人群或医护人员中感染的增加。未来的研究可能包括对流行趋势的预测以及对家庭或其他地方人对人传播的专门研究，而血清调查以确定亚临床感染的发生率将是有价值的。这些最初的推论在“行列表”上列出，其中包含有关每个确诊病例的详细个人信息，但是可能很快就会有太多病例无法维持这种监视方法，因此可能需要其他方法。本文表达的观点仅代表作者个人观点，并不代表中国疾病预防控制中心的官方政策。所有作者都宣称没有任何关系或活动可能影响到这项工作。在中国科学技术部的支持下，中国国家科技重大专项（ZX----，ZX10101-），中美新兴和新兴国家合作计划传染病和国家传染病超级项目（ZX--），国家自然科学基金会（71934），国家过敏和传染病研究所（流感研究和监测卓越中心[CEIRS]合约编号：HH-SNC）和健康与医学研究基金会（香港）。没有研究者在研究设计，数据的收集，分析和解释，文章的撰写以及将其提交发表的决定中发挥任何作用。研究人员证实他们独立于资助者和赞助者。作者提供的披露表可在NEJM.org上获得本文的全文。我们感谢武汉市疾病预防控制中心，黄冈疾病预防控制中心以及武汉市其他地方疾病预防控制中心和医疗机构在现场调查管理和数据收集方面的帮助，并感谢中国疾病预防控制中心国家病毒性疾病预防控制中心在实验室检测方面的帮助。

原文：

LiQ,GuanX,WuP,WangX,ZhouL,TongY,RenR,LeungKSM,LauEHY,WongJY,XingX,XiangN,WuY,LiC,ChenQ,LiD,LiuT,ZhaoJ,LiM,TuW,ChenC,JinL,YangR,WangQ,ZhouS,WangR,LiuH,LuoY,LiuY,ShaoG,LiH,TaoZ,YangY,DengZ,LiuB,MaZ,ZhangY,ShiG,LamTTY,WuJTK,GaoGF,CowlingBJ,YangB,LeungGM,FengZ.EarlyTransmissionDynamicsinWuhan,China,ofNovelCoronavirus-InfectedPneumonia.NEnglJMed.Jan29.doi:10./NEJMoa.[Epubaheadofprint]PubMedPMID:.

译者述评：

从这篇文章，尤其是花大力气翻译的图1可以对大家质疑的中国CDC（疾病预防控制中心）不作为做出完美的回答。中国卫健委和CDC在疫情发生的全过程都给予了极大的